Cela dit, les créateurs de VirtualBox ont pensés à tout !

Il existe dans le gestionnaire "VBoxManage.exe" une option permettant de cloner un fichier vdi en lui assignant un nouvel UUID.

C:\Program Files\Sun\xVM VirtualBox>VBoxManage clonevdi "d:\vbox\ubuntu_dev_model.vdi" "d:\vbox\ubuntu_dev_prj1.vdi"  

Et voila, vous pouvez créer autant de copie de votre VM originale et les ajouter dans votre VirtualBox.